菌落分析計數(shù)儀是一種幫助實驗人員對菌落進行計數(shù)的儀器，可以減輕實驗人員的勞動強度，提高工效，提高工作質(zhì)量，是各級防疫站、環(huán)境監(jiān)測站、食品衛(wèi)生監(jiān)督檢驗所、醫(yī)院、生物制品所、藥檢所、商檢局、食品廠、飲料廠、化妝品廠、日化廠及大專院校、科研單位實驗室等的儀器。
分析軟件是菌落分析計數(shù)儀的另一塊核心成分。因為菌落生物的存在多樣性，在培養(yǎng)基上的表現(xiàn)或顯像不可能大體一致，針對這類變化，在分析軟件選型上要考慮，市場上的一些產(chǎn)品的軟件功能主要有一下幾個方面：
圖像處理：圖像調(diào)節(jié)(灰度圖、負相圖轉(zhuǎn)換、對比度、RGB分割...)、圖像增強...
圖像編輯：文字嵌入、圖形嵌入
統(tǒng)計功能：菌落智能識別技術(shù)(很重要)、區(qū)域選擇統(tǒng)計、直徑分類統(tǒng)計、鼠標(biāo)單擊計數(shù)、顏色識別統(tǒng)計、人工計數(shù)修正、排除污染區(qū)域計數(shù)、自動換算功能、自動雜質(zhì)剔除、粘連菌落分割、菌落形態(tài)學(xué)分析、多通道分割...
測量功能：自動分析菌落直徑、面積等精確測量長度、角度、面積等
數(shù)據(jù)管理：數(shù)據(jù)自動存儲、查詢、Excel導(dǎo)出報表打印、數(shù)據(jù)庫權(quán)限設(shè)置
高級功能：抑菌圈測量、紙片法藥敏分析、多培養(yǎng)皿統(tǒng)計、螺旋平皿統(tǒng)計
對于科研、質(zhì)檢部門在菌落儀的要求上也越來越高，一些產(chǎn)品的軟件功能應(yīng)該能夠滿足客戶的需要，但是對與一些特殊實驗應(yīng)用面來說，在功能上還有待加強。除軟件功能，另外一點也不得不提，那就是操作。人們越來越講究人機結(jié)合的舒適性，講究產(chǎn)品功能的強大和操作的簡單化成反比。對用用戶來說才算是真正解放。
